Il territorio del Cono Sud è suddivisibile in due grandi aree morfologicamente assai diverse: quella occidentale, costituita da montagne, e quella orientale, caratterizzata da vaste pianure.
Le montagne sono quelle della cordigliera andina, nelle sue porzioni centrale e australe. Sono presenti numerosi vulcani attivi e la zona è soggetta a frequenti terremoti.
Il territorio orientale della regione è occupato da vaste pianure. A nord il Gran Chaco, un vastissimo bassopiano, dove le foreste si alternano alle savane e i corsi d'acqua si perdono nel sottosuolo. Il Chaco australe e quello centrale appartengono all'Argentina, quello boreale al Paraguay.
A sud al Gran Chaco seguono le sterminate ''pampas'', ricche di pascoli. A est, tra i fiumi Paranà (il più lungo: 4.700 km) e Uruguay (suo affluente) è compresa la Mesopotamia argentina, bassa e paludosa. Più a sud si estendono le ''mesetas'' della Patagonia, steppe fredde, piuttosto aride e poco popolate.
Quasi tutti i laghi della regione sono glaciali e distribuiti nella catena andina. Il maggiore è quello denominato lago Buenos Aires dagli argentini e lago Generale Carrera dai cileni. Situato in Patagonia, è tagliato in due dal confine tra Argentina e Cile.
